RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 AK9Q5TCS8 1911 aa24.61■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 GRIK5Q16478 980 aa24.61■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 ABCF2Q9UG63 623 aa24.61■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 A0A0D9SFI3 127 aa24.6■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 CHD4Q14839 1912 aa24.6■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 MED23Q9ULK4 1368 aa24.59■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC93Q567U6 631 aa24.59■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 MXD3Q9BW11 206 aa24.59■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.58■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.58■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 NFKBIEO00221 500 aa24.56■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 PRDX5P30044 214 aa24.56■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF384Q8TF68 577 aa24.56■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.56■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.56■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 COL4A5P29400 1685 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 IL1R1P14778 569 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 PRELPP51888 382 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 RASSF7Q02833 373 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 FBXW7Q969H0 707 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 PPIP5K2O43314 1243 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 GTF2IP78347 998 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.55■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.53■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 OSBP2Q969R2 916 aa24.53■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.53■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.53■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.53■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 YDJCA8MPS7 323 aa24.52■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.52■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.52■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 EYA3Q99504 573 aa24.52■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 ECE2O60344 883 aa24.52■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 COA1Q9GZY4 146 aa24.52■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 RAI14Q9P0K7 980 aa24.52■■□□□ 1.52
TMCO3-201ENST00000375391 G3V3G9 751 aa24.51■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 M0R2C6 588 aa24.51■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 SGSM2O43147 1006 aa24.51■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 PDE6AP16499 860 aa24.51■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.51■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.51■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 SCN9AQ15858 1988 aa24.51■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.513e-9■■■■□ 20.7
TMCO3-201ENST00000375391 PSMD1Q99460 953 aa24.5■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 ADD2P35612 726 aa24.5■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 CASC1Q6TDU7 716 aa24.5■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 CERS5Q8N5B7 392 aa24.5■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.5■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 SEMA3EO15041 775 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 PTH1RQ03431 593 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 VPS53Q5VIR6 699 aa24.49■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 F8W031 263 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.48■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.48■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 MAST3O60307 1309 aa24.47■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 MECOMQ03112 1051 aa24.47■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.47■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 MAP3K12Q12852 859 aa24.46■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.46■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 RAD17O75943 681 aa24.46■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.46■■□□□ 1.51
TMCO3-201ENST00000375391 SOGA3Q5TF21 947 aa24.45■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.45■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.45■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 USP26Q9BXU7 913 aa24.45■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.44■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 PODNQ7Z5L7 613 aa24.44■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.44■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 CYP7A1P22680 504 aa24.44■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 DOCK2Q92608 1830 aa24.43■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 APPBP2Q92624 585 aa24.43■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.43■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 HIP1O00291 1037 aa24.43■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 FOXP2O15409 715 aa24.43■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TMCO3-201ENST00000375391 MYH7P12883 1935 aa24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms