RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD7Q92527 254 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.52□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CRB1P82279 1406 aa8.52□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC66A2RUB6 948 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 FAM83GA6ND36 823 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CHL1O00533 1208 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC192P0DO97 292 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CTHP32929 405 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PDE1AP54750 535 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 FAM196BA6NMK8 535 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 MCM10Q7L590 875 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 DPYDQ12882 1025 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 DESI1Q6ICB0 168 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 USP48Q86UV5 1035 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 IFNL2Q8IZJ0 200 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 BTG4Q9NY30 223 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SMTNL1A8MU46 457 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 NEMFO60524 1076 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 GNAI3P08754 354 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 IL2RBP14784 551 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ATP2B4P23634 1241 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN10P78369 228 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 TEFQ10587 303 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 DCTN1Q14203 1278 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 TSPYL6Q8N831 410 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 MEGF6O75095 1541 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CACNA1FO60840 1977 aa8.5□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 GNAI2P04899 355 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CBX1P83916 185 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 RNF20Q5VTR2 975 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 STRN4Q9NRL3 753 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 STAP2Q9UGK3 403 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PRMT3O60678 531 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA1LP34931 641 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 RNF135Q8IUD6 432 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 OGFOD1Q8N543 542 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 IL17REQ8NFR9 667 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 NRAPQ86VF7 1730 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP33O14559 1287 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 RNMTO43148 476 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 STX6O43752 255 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 GIPC2Q8TF65 315 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF5Q96JK2 942 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 ELP1O95163 1332 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-201ENST00000372616 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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