RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 SNAP23O00161 211 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 PPIP5K2O43314 1243 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 ATP2B4P23634 1241 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 ADORA1P30542 326 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 GPSM2P81274 684 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 AOC3Q16853 763 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC102BQ68D86 513 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 CHMLP26374 656 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 VPS37DQ86XT2 251 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 NIM1KQ8IY84 436 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 GPC2Q8N158 579 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 MPNDQ8N594 471 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 FSD1Q9BTV5 496 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 VPS33BQ9H267 617 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 HACL1Q9UJ83 578 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 SCN4AP35499 1836 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 SEMA3EO15041 775 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 CHADLQ6NUI6 762 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 IGSF3O75054 1194 aa21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 GGA1Q9UJY5 639 aa21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 RAD50Q92878 1312 aa21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-201ENST00000324444 EPHX2P34913 555 aa21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 LDHDQ86WU2 507 aa21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 POLLQ9UGP5 575 aa21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 GOLIM4O00461 696 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 KLRK1P26718 216 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 PHKA1P46020 1223 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 MED23Q9ULK4 1368 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 UFL1O94874 794 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 KLRG1Q96E93 195 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA5Q8NB90 893 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 MCAMP43121 646 aa21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 BCAMP50895 628 aa21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 AK9Q5TCS8 1911 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 SEC24BO95487 1268 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 MCCP23508 829 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 ZAP70P43403 619 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 SCNN1DP51172 638 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 EYA3Q99504 573 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 SGSM2O43147 1006 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 CXCL9Q07325 125 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-201ENST00000324444 EPS15P42566 896 aa21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 GYG1P46976 350 aa21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K12Q12852 859 aa21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 WASHC4Q2M389 1173 aa21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 C6orf229H3BNL8 230 aa21.69■■□□□ 1.06
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