RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TM4SF18Q96CE8 201 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SEH1LQ96EE3 360 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR2A7Q96R45 310 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PALLDQ8WX93 1383 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NRCAMQ92823 1304 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 A0A087WWV3 80 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NTN1O95631 604 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRBV12-3P01733 135 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TTRP02766 147 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM236CP0DP71 79 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AKR1C3P42330 323 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MARCKSL1P49006 195 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TAS2R19P59542 299 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IHHQ14623 411 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DNAJC24Q6P3W2 148 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF614Q8N883 585 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCL17Q92583 94 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GALNT14Q96FL9 552 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GPER1Q99527 375 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C1orf50Q9BV19 199 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MS4A8Q9BY19 250 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCDC90BQ9GZT6 254 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR51I2Q9H344 312 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AIG1Q9NVV5 245 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DPM3Q9P2X0 92 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GRIN2BQ13224 1484 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PTPRKQ15262 1439 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 M0QYV0 167 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC17A3O00476 420 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EDIL3O43854 480 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TBL1XO60907 577 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HBZP02008 142 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RAB3AP20336 220 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LMO2P25791 158 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF138P52744 262 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PNOCQ13519 176 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C6orf99Q4VX62 202 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR2B11Q5JQS5 317 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLET1Q6UQ28 207 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF550Q7Z398 422 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR52L1Q8NGH7 329 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR5J2Q8NH18 312 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FXYD5Q96DB9 178 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR52E6Q96RD3 313 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC01587Q99440 93 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LRTM1Q9HBL6 345 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HES2Q9Y543 173 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SOGA1O94964 1423 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCDC171Q6TFL3 1326 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PGPA6NDG6 321 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MPTX1A8MV57 137 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UPK2O00526 184 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BET1O15155 118 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ORC5O43913 435 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SERPINB7O75635 380 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR2J2O76002 312 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF20P17024 532 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDKN2BP42772 138 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CD47Q08722 323 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BATFQ16520 125 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms