RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PSG9	Q00887	426 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	GLRX	P35754	106 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	RPE	Q96AT9	228 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	BANF2	Q9H503	90 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467		H7C1H1	209 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467		K7N7A8	449 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	F2RL2	O00254	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PTP4A3	O75365	173 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SP1	P08047	785 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CTGF	P29279	349 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	GALR1	P47211	349 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	HTR6	P50406	440 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	FOXA1	P55317	472 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	FXYD4	P59646	89 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	GUK1	Q16774	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PITX3	O75364	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MYOD1	P15172	320 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MAGEB1	P43366	347 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PGGT1B	P53609	377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CHEK1	O14757	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C1orf61	Q13536	156 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	COL4A5	P29400	1685 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	HMX2	A2RU54	273 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CCS	O14618	274 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MGST3	O14880	152 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	FABP7	O15540	132 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	FRS3	O43559	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR2C1	O95371	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ONECUT2	O95948	504 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	HPRT1	P00492	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SPN	P16150	400 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CCL7	P80098	99 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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