RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SHISA3A0PJX4 238 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 MEGF11A6BM72 1044 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CCDC160A6NGH7 325 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 A6NIN4 97 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CAPZA1P52907 286 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PLCXD3Q63HM9 321 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 NCR3LG1Q68D85 454 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 KRT74Q7RTS7 529 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 OR5A2Q8NGI9 324 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 OR5R1Q8NH85 324 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PHYHIPQ92561 330 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 THRSPQ92748 146 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 FGGYQ96C11 551 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 SDSLQ96GA7 329 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 FAM192AQ9GZU8 254 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PIGLQ9Y2B2 252 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 DHRS7CA6NNS2 312 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 NOL3O60936 208 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CD2P06729 351 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CCL3L1P16619 93 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CALRP27797 417 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 BMXP51813 675 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 SPCS2Q15005 226 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B12Q53GQ0 312 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 TMEM200BQ69YZ2 307 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 C11orf42Q8N5U0 333 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PARP16Q8N5Y8 322 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ZNF671Q8TAW3 534 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 NDNFQ8TB73 568 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 KCTD7Q96MP8 289 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 GPR173Q9NS66 373 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R4Q9NYW5 299 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 G3V4G9 280 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A1O15245 554 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CHST1O43916 411 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ARL6IP5O75915 188 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 NRASP01111 189 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CSF1P09603 554 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ZNF20P17024 532 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 FSTP19883 344 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 COX7A1P24310 79 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 HAAOP46952 286 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 EFNB2P52799 333 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ZNF273Q14593 569 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 C2orf68Q2NKX9 166 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB37Q5TC79 503 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 TMEM42Q69YG0 159 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ZNF529Q6P280 563 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 LRRTM1Q86UE6 522 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 LYG1Q8N1E2 194 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 POC1AQ8NBT0 407 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 OR5D13Q8NGL4 314 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ITFG2Q969R8 447 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 C10orf35Q96D05 121 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHA1Q9HB21 404 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 FBLN5Q9UBX5 448 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 A0A0G2JK05 382 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 OR5B21A6NL26 309 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PGA5P0DJD9 388 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PRDX2P32119 198 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 SDC2P34741 201 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 SERPINB10P48595 397 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 MTNR1BP49286 362 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 RPL31P62899 125 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 HERPUD1Q15011 391 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PLA1AQ53H76 456 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 UTS2BQ765I0 119 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 OR51A2Q8NGJ7 313 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 OR13C9Q8NGT0 318 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PIFOQ8TCI5 191 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 PP6455Q8WZ26 134 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 GFI1Q99684 422 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 CHST5Q9GZS9 411 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 DCSTAMPQ9H295 470 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms