RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF691Q5VV52 312 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ELP2Q6IA86 826 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 LYG1Q8N1E2 194 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 CHST4Q8NCG5 386 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 Q8NFD4 153 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 GLS2Q9UI32 602 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 WNK1Q9H4A3 2382 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 A0A087X0M5 115 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1B0GX30 115 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 FAM172BPA6NC97 362 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 LY6LH3BQJ8 138 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 F2RL2O00254 374 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF44P15621 663 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 HTR1DP28221 377 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 ETV1P50549 477 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 SLC34A1Q06495 639 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 LPCAT4Q643R3 524 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 ASCL4Q6XD76 172 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 PXT1Q8NFP0 134 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 NDNFQ8TB73 568 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 Q96MT0 163 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 NEK6Q9HC98 313 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 DPM3Q9P2X0 92 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 DHDHQ9UQ10 334 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 TGP01266 2768 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 FBXO24O75426 580 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 HCKP08631 526 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC159P0C7I6 412 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OCM2P0CE71 109 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM225BP0DP42 221 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 CD24P25063 80 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 MTNR1BP49286 362 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 PAX5Q02548 391 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OR52W1Q6IF63 320 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 DTX3Q8N9I9 347 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 MMP28Q9H239 520 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 FUOMA2VDF0 154 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 H0YJX3 145 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 DEGS1O15121 323 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 CLIC3O95833 236 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 LALBAP00709 142 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 AMY1AP04745 511 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 AMY2AP04746 511 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 RAB3AP20336 220 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 PTGFRP43088 359 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 SOX2P48431 317 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 SCN1BQ07699 218 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 IL13RA2Q14627 380 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 ZSCAN26Q16670 478 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 PIGYQ3MUY2 71 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OR13A1Q8NGR1 328 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 KIRREL1Q96J84 757 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 RDH12Q96NR8 316 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-211ENST00000467464 OR5M11Q96RB7 305 aa9.56□□□□□ -0.88
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