RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 RNF126Q9BV68 326 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CHST6Q9GZX3 395 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLITRK2Q9H156 845 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NIT2Q9NQR4 276 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TRPC4Q9UBN4 977 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 STARD10Q9Y365 291 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TMED7Q9Y3B3 224 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KPTNQ9Y664 436 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SERINC4A6NH21 518 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C2orf74A8MZ97 194 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C4orf51C9J302 202 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 I3L1I5 382 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SIGLEC5O15389 551 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FCMRO60667 390 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CLN5O75503 358 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CD3DP04234 171 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TACSTD2P09758 323 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CLUP10909 449 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ACKR3P25106 362 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PSMB6P28072 239 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CD34P28906 385 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GLP1RP43220 463 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 P2RY4P51582 365 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ARHGDIBP52566 201 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB4BP61018 213 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FAM3AP98173 230 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SIGLEC14Q08ET2 396 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PON3Q15166 354 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ELOCQ15369 112 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CCL14Q16627 93 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KCTD9Q7L273 389 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OLIG3Q7RTU3 272 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NAA40Q86UY6 237 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CDC20BQ86Y33 519 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR2L8Q8NGY9 312 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NT5CQ8TCD5 201 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 AQP3Q92482 292 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FGF13Q92913 245 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PRAP1Q96NZ9 151 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PRRT1Q99946 306 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CHST5Q9GZS9 411 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR51V1Q9H2C8 321 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TMEM185BQ9H7F4 350 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RHOFQ9HBH0 211 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 COMMD9Q9P000 198 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GHRLQ9UBU3 117 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CD84Q9UIB8 345 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 WDR45Q9Y484 360 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.13□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GWJ7 208 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PPE3 182 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR6C74A6NCV1 312 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 K7EQD1 137 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 M0R296 226 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF208O43345 1280 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR2T1O43869 369 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SCGNO76038 276 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GOSR1O95249 250 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB3DO95716 219 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms