RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 BRICD5Q6PL45 260 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 WDR31Q8NA23 367 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PKIBQ9C010 78 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SYNGR1O43759 233 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CGAP01215 116 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 RPA2P15927 270 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PI3P19957 117 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 HOXC12P31275 282 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 S100A11P31949 105 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 IL24Q13007 206 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PDCD1Q15116 288 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 TSC22D1Q15714 1073 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZPA2 131 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00596Q86U02 117 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 BATF2Q8N1L9 274 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PLK3Q9H4B4 646 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 IFNA7P01567 189 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 RAC2P15153 192 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CA6P23280 308 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 GLRA1P23415 457 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 UCP2P55851 309 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM65Q6PI78 240 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PCSK4Q6UW60 755 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD9Q7L273 389 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 STARD4Q96DR4 205 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 HS3ST6Q96QI5 342 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 OR51I2Q9H344 312 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 COMMD9Q9P000 198 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PROCRQ9UNN8 238 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 FAM221AA4D161 298 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 IQCF6A8MYZ5 107 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 WDR1O75083 606 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CRHP06850 196 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A4P12235 298 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PGAM2P15259 253 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CALCRP30988 508 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SLC22A25Q6T423 547 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZS49 121 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 TMUB2Q71RG4 321 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 OR1J1Q8NGS3 322 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 COQ8AQ8NI60 647 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC120Q96HB5 630 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SEC22AQ96IW7 307 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 RTL8AQ9BWD3 113 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 LIME1Q9H400 295 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 RHOFQ9HBH0 211 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 RAB18Q9NP72 206 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 OBP2BQ9NPH6 170 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 IL36RNQ9UBH0 155 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 J3QT63 122 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 NAPSAO96009 420 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV1-44P01699 117 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SELEP16581 610 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PTGER4P35408 488 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 ERVS71-1P61550 626 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 IL13RA2Q14627 380 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 P2RY6Q15077 328 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 BEND4Q6ZU67 534 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 MICU1Q9BPX6 476 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-208ENST00000502484 NMES1Q9C002 83 aa6.99□□□□□ -1.29
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