RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLN8Q9UBY8 286 aa3.64□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.64□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 POMPQ9Y244 141 aa3.64□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRP12Q9Y561 859 aa3.64□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.64□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 VWFP04275 2813 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PP11 408 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PRD5 423 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PRF3 423 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PRM7 423 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC182A6NF36 153 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 OOEPA6NGQ2 149 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 A6NIN4 97 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM77I1YAP6 450 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHYHO14832 338 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCN3O75636 299 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLCEO94923 617 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYOD1P15172 320 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACKR3P25106 362 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPRL1P41146 370 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPM6AP51674 278 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM3AP98173 230 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAMBIQ13145 260 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDX4Q13162 271 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNAPC1Q16533 368 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ODF4Q2M2E3 257 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGSF11Q5DX21 431 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR38Q5JTN6 314 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT77Q7Z794 578 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIGD4Q8IY51 512 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNKDQ8N490 385 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3orf56Q8N813 242 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTOSQ8NHW6 89 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 THAP6Q8TBB0 222 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 THEM6Q8WUY1 208 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGCQ92535 297 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDOQ99489 341 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKP2Q99959 881 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIBC2Q9H4K1 309 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPA3Q9H6K4 179 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 NIPAL2Q9H841 368 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM165Q9HC07 324 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIOXQ9UGB7 285 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP50Q9UKX7 468 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 COPS3Q9UNS2 423 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.63□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GWJ7 208 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANXA2P2A6NMY6 339 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 J3QR06 171 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 LGALS8O00214 317 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDIPTO14735 213 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKR7A2O43488 359 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKYO43930 277 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 WNT2P09544 360 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC2A5P22732 501 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBG1P23258 451 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAX6P26367 422 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPHA2P29317 976 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFHR2P36980 270 aa3.62□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAPP51397 102 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms