RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 CDRT1O95170 752 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CYB5AP00167 134 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV4-59P01825 116 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ALDOBP05062 364 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CELP19835 753 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GABRR1P24046 479 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 LMO1P25800 156 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2E1P51965 193 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 EDDM3BP56851 147 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MED21Q13503 144 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GRK1Q15835 563 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 Q499Y3 187 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ASCL4Q6XD76 172 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 PXT1Q8NFP0 134 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CHIAQ9BZP6 476 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 DUSP21Q9H596 190 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 NOX4Q9NPH5 578 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PP11 408 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MEIOCA2RUB1 952 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 H0YHG0 523 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GPX5O75715 221 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MMP23AO75900 390 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CD2P06729 351 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 HKR1P10072 659 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 COX7A1P24310 79 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 BDKRB2P30411 391 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SAA4P35542 130 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 IER3P46695 156 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 BMXP51813 675 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 RELBQ01201 579 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GUCA2AQ02747 115 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SCN1BQ07699 218 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 RIPK1Q13546 671 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 PIGYQ3MUY2 71 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 AWAT1Q58HT5 328 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 DDI2Q5TDH0 399 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ELP2Q6IA86 826 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 C16orf87Q6PH81 154 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 LYPD6Q86Y78 171 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 Q8NFD4 153 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A28Q96A46 364 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CYYR1Q96J86 154 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 DERL3Q96Q80 235 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GPER1Q99527 375 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 PPA2Q9H2U2 334 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SH2D1BO14796 132 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CD1AP06126 327 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF728P0DKX0 622 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF44P15621 663 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 FSTP19883 344 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OMGP23515 440 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CRHBPP24387 322 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TGFBR2P37173 567 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 PTGFRP43088 359 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MAP2K4P45985 399 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GLIPR1P48060 266 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MTNR1BP49286 362 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 P2RX3P56373 397 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TAS2R43P59537 309 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 PPP3R1P63098 170 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 AESQ08117 197 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ACSM1Q08AH1 577 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 BLMHQ13867 455 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TAF9Q16594 264 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 UTF1Q5T230 341 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MYDGFQ969H8 173 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 COQ2Q96H96 371 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CNBD2Q96M20 576 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MND1Q9BWT6 205 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms