RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CHST6Q9GZX3 395 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PPE2 198 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PPK0 400 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PR64 198 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PRV1 198 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM89A2RUT3 159 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GABRPO00591 440 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GPX5O75715 221 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2H2O95918 312 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL3L1P16619 93 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 LMO1P25800 156 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 BDKRB2P30411 391 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TGFBR2P37173 567 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVFRD-1P60508 538 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35A2P78381 396 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SCN1BQ07699 218 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ACSM1Q08AH1 577 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4S1Q8NGB4 309 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R35Q8TAP8 253 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP21Q9H596 190 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM96BQ9Y3D0 163 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SIRPB1O00241 398 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DEGS1O15121 323 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 NPFFO15130 113 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PTGFRP43088 359 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MTNR1BP49286 362 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 BMXP51813 675 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 BDH1Q02338 343 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 EDDM3AQ14507 147 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SPHARQ15513 63 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DDI2Q5TDH0 399 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ELP2Q6IA86 826 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HCP5Q6MZN7 132 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6P435 159 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ASCL4Q6XD76 172 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PNKDQ8N490 385 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 OR14A2Q96R54 314 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5M11Q96RB7 305 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF19Q9NS68 423 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CKLFQ9UBR5 152 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ING4Q9UNL4 249 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0G2JK05 382 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MGST3O14880 152 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MELTFP08582 738 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF44P15621 663 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DLX6P56179 175 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 IRF3Q14653 427 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RSU1Q15404 277 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 C16orf87Q6PH81 154 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 TPRX1Q8N7U7 411 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CNBD2Q96M20 576 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM192AQ9GZU8 254 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 hADV38S2A0JD32 116 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MEIOCA2RUB1 952 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf98A8MV24 154 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF728P0DKX0 622 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CRHBPP24387 322 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ERP29P30040 261 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 VHLP40337 213 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 OR3A1P47881 315 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 OR3A4PP47883 348 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MED22Q15528 200 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf54Q6X4T0 127 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8NFD4 153 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10K1Q8NGX5 313 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB26Q9ULW5 256 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXJ3Q9UPW0 622 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PIN1P1O15428 100 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS10O43665 173 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CDRT1O95170 752 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HTR3BO95264 441 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM86BQ8N661 226 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CHST4Q8NCG5 386 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DERL3Q96Q80 235 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL9Q9H1A3 318 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HKR1P10072 659 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 FSTP19883 344 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SAA4P35542 130 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 IER3P46695 156 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 COMPP49747 757 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ACSM3Q53FZ2 586 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A15Q8N5U1 240 aa17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms