RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 B9D2Q9BPU9 175 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 UQCC2Q9BRT2 126 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 MRI1Q9BV20 369 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 SHISA3A0PJX4 238 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 A6NLC8 198 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 IFITM5A6NNB3 132 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 AIPO00170 330 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM225BP0DP42 221 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 HTR2CP28335 458 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 POU3F4P49335 361 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 CAV3P56539 151 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10A3P58181 314 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 KISS1Q15726 138 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 MSMPQ1L6U9 139 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 HES5Q5TA89 166 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 AWAT2Q6E213 333 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10AD1Q8NGE0 317 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
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CAPNS1-209ENST00000590049 SPACA5Q96QH8 159 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 DECR2Q9NUI1 292 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 C17orf100A8MU93 164 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC17A2O00624 439 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 PLATP00750 562 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 CRYBA1P05813 215 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 GRPP07492 148 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 UBBP0CG47 229 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 NAT2P11245 290 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 TNFRSF1AP19438 455 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 S100A5P33763 92 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 HAAOP46952 286 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 MMP15P51511 669 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 PCGF3Q3KNV8 242 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF404Q494X3 552 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 MKXQ8IYA7 352 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 OR5D18Q8NGL1 313 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 MCFD2Q8NI22 146 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 RFT1Q96AA3 541 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 GHRLQ9UBU3 117 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 ING4Q9UNL4 249 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.63□□□□□ -0.87
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CAPNS1-209ENST00000590049 F5H5P2 479 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 H0YL77 283 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 RGS5O15539 181 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 MLNRO43193 412 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 CLPXO76031 633 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFA7O95182 113 aa9.63□□□□□ -0.87
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CAPNS1-209ENST00000590049 ARSBP15848 533 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR176Q14439 515 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 PDCD1Q15116 288 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 RSU1Q15404 277 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM255AQ5JRV8 349 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM209AQ5JX71 171 aa9.63□□□□□ -0.87
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CAPNS1-209ENST00000590049 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 PHF21AQ96BD5 680 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 CEP19Q96LK0 163 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 CST11Q9H112 138 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 METTL9Q9H1A3 318 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 IL19Q9UHD0 177 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF114Q9Y508 228 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.62□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.62□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 J3QT63 122 aa9.62□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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