RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 SPACA5Q96QH8 159 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 COMMD4Q9H0A8 199 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CLIC3O95833 236 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 MT-ND2P03891 347 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 RPSAP08865 295 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC159P0C7I6 412 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 GABRR1P24046 479 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 COX7A1P24310 79 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SNU13P55769 128 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 DLX6P56179 175 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 EDDM3AQ14507 147 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 C17orf107Q6ZR85 190 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF144BQ7Z419 303 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 OR5R1Q8NH85 324 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CYGBQ8WWM9 190 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 NEK6Q9HC98 313 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 GLS2Q9UI32 602 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 C17orf98A8MV24 154 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV1D-12P01611 117 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 LIMS3P0CW19 117 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 LIMS4P0CW20 117 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF728P0DKX0 622 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PEX2P28328 305 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 BMXP51813 675 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 LGALS4P56470 323 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF146Q15072 292 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 RCN1Q15293 331 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 GRK1Q15835 563 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SPIN3Q5JUX0 258 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF691Q5VV52 312 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SERPINA12Q8IW75 414 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 OR52N4Q8NGI2 321 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 AJUBAQ96IF1 538 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SSX3Q99909 188 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 JAM3Q9BX67 310 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CHST6Q9GZX3 395 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF696Q9H7X3 374 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 HMG20AQ9NP66 347 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 DHDHQ9UQ10 334 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 H3BUX3 64 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SULT1B1O43704 296 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PSPNO60542 156 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 HCKP08631 526 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 DCKP27707 260 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ETV1P50549 477 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR31Q5SQ13 230 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TTC23Q5W5X9 447 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZSV7 163 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PARP16Q8N5Y8 322 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PACRGLQ8N7B6 248 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TPRX1Q8N7U7 411 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01006Q8NI28 216 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 C8orf4Q9NR00 106 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF114Q9Y508 228 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 hADV38S2A0JD32 116 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 IRGMA1A4Y4 181 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SIRPB1O00241 398 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SH2D1BO14796 132 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM4BO94953 1096 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ALX3O95076 343 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 RBP4P02753 201 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PAX6P26367 422 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TGFBR2P37173 567 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TCF23Q7RTU1 214 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SAXO1Q8IYX7 474 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 DHRSXQ8N5I4 330 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF714Q96N38 554 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 MGST3O14880 152 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 OR2H2O95918 312 aa13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms