RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 CCL20P78556 96 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 GNMTQ14749 295 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST3H3Q16695 136 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A53Q5H9E4 307 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SPSB3Q6PJ21 355 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 KMT5CQ86Y97 462 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SLC2A9Q9NRM0 540 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA5BQ9P283 1151 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HSF4Q9ULV5 492 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HSD17B6O14756 317 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SRP19P09132 144 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 CXCL1P09341 107 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SFTPDP35247 375 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RRADP55042 308 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 FXYD4P59646 89 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2KP61086 200 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF266Q14584 549 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 PHLDA2Q53GA4 152 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR2G3Q8NGZ4 309 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 FAAP24Q9BTP7 215 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1456Q9P272 454 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 AK3Q9UIJ7 227 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 PIGLQ9Y2B2 252 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OPRM1P35372 400 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 PLPPR5Q32ZL2 321 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR5L1Q8NGL2 311 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR4D5Q8NGN0 318 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 POC1BQ8TC44 478 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 PIGQQ9BRB3 760 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 PRDM13Q9H4Q3 707 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 GFOD1Q9NXC2 390 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 TCFL5Q9UL49 500 aa12.99□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 PI4KAP42356 2102 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 CXorf65A6NEN9 183 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V0CP27449 155 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RND3P61587 244 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF343Q6P1L6 599 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OXGR1Q96P68 337 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SYT3Q9BQG1 590 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ANGPTL4Q9BY76 406 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SIRT7Q9NRC8 400 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF726A6NNF4 738 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF814B7Z6K7 855 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 F5H5K5 113 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BKO60814 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF205O95201 554 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BJP06899 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BOP23527 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BBP33778 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ASCL1P50553 236 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BDP58876 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BCP62807 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 CCL7P80098 99 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 SPNS3Q6ZMD2 512 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZSR3 168 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 DTX1Q86Y01 620 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 FBXL14Q8N1E6 418 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR2C3Q8N628 320 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR10D4PQ8NGN7 298 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR14L1PQ8NHC6 308 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf35Q96D05 121 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 CEP192Q8TEP8 1941 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC187A0A096LP49 1063 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PNR3 127 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PQM1 296 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 LY86O95711 162 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 GLI4P10075 376 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 KLK2P20151 261 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 LSM6P62312 80 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 DLK1P80370 383 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HAGHQ16775 308 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 DBX2Q6ZNG2 339 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 UFSP2Q9NUQ7 469 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RARRES3Q9UL19 164 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 CDRT15L2A8MXV6 281 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF587BE7ETH6 402 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 H0YL77 283 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 GDF9O60383 454 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 PITX3O75364 302 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 F10P00742 488 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 FOSL1P15407 271 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 MSX1P28360 303 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ERVFRD-1P60508 538 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 DNLZQ5SXM8 178 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.4 ms