RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638159.1

GABRA1-220, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GABRA1, Length 4,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1-220ENST00000638159 TPRA1Q86W33 373 aa3.51□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 STPG2Q8N412 459 aa3.51□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ITFG2Q969R8 447 aa3.51□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 MROQ9BYG7 248 aa3.51□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 COL12A1Q99715 3063 aa3.51□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 RFPL4AA6NLU0 287 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 H3BN98 237 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 UBDO15205 165 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 FGF16O43320 207 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 FCMRO60667 390 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ADAP1O75689 374 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CD2P06729 351 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TMEM225BP0DP42 221 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 EPHA2P29317 976 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TFPI2P48307 235 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 BLCAPP62952 87 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 PLAURQ03405 335 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 STX3Q13277 289 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 HAGHQ16775 308 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ZNF561Q8N587 486 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ZNF488Q96MN9 340 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 P2RX4Q99571 388 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 RASL12Q9NYN1 266 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 RABAC1Q9UI14 185 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 J3QR06 171 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 PRKACBP22694 351 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 MTNR1BP49286 362 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ATP5G2Q06055 141 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 SYPL1Q16563 259 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 RRN3P1Q2M238 152 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CALHM1Q8IU99 346 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TMEM239Q8WW34 195 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 REEP6Q96HR9 211 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 Q96MT0 163 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CLCC1Q96S66 551 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 PECRQ9BY49 303 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 SAR1AQ9NR31 198 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 SIRPB1O00241 398 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 MGST3O14880 152 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CHP2O43745 196 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 SPAG7O75391 227 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 IDO1P14902 403 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 HSPA13P48723 471 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CAV3P56539 151 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 HOXC5Q00444 222 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TPBGQ13641 420 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 IDNKQ5T6J7 187 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 C16orf89Q6UX73 402 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 PRR18Q8N4B5 295 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 SDSLQ96GA7 329 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.5□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 G3V2T6 193 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CLIC1O00299 241 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 AHCYL1O43865 530 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 EFNA2O43921 213 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 OR7A10O76100 309 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CD14P08571 375 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 THRBP10828 461 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ATP6V1B1P15313 513 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ZNF3P17036 446 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CD24P25063 80 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 ERVFC1-1P60608 527 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 MGAT2Q10469 447 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 UNC50Q53HI1 259 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 LIN54Q6MZP7 749 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 LYG2Q86SG7 212 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 TMEM54Q969K7 222 aa3.49□□□□□ -1.85
GABRA1-220ENST00000638159 LGALS12Q96DT0 336 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms