RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556247.1

LRP1-210, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LRP1, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-210ENST00000556247 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 F8VVB4 439 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 F8VWA3 439 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 H3BUI4 141 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 RBBP9O75884 186 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 NXPH2O95156 264 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ADH4P08319 380 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PGA5P0DJD9 388 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GNB3P16520 340 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 IGFBP2P18065 325 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 RGS21Q2M5E4 152 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 POC5Q8NA72 575 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PECRQ9BY49 303 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 MEIOCA2RUB1 952 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 TMEM235A6NFC5 223 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 LANCL1O43813 399 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 MELTFP08582 738 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GSTT2BP0CG30 244 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GNG2P59768 71 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ERVK11-1P61568 191 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GUCA2AQ02747 115 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 WDR82Q6UXN9 313 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 MOGAT3Q86VF5 341 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 MUC15Q8N387 334 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 SETD6Q8TBK2 473 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 VGLL3A8MV65 326 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 MFNGO00587 321 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ORC5O43913 435 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 LPLP06858 475 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 CD55P08174 381 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GDNFP39905 211 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GMFBP60983 142 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ARFRP1Q13795 201 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 IL13RA2Q14627 380 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PDCD1Q15116 288 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 MPV17LQ2QL34 196 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 MST1LQ2TV78 715 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 LINC00596Q86U02 117 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GPX8Q8TED1 209 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 LRRC29Q8WV35 223 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 TRIM63Q969Q1 353 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FBXW5Q969U6 566 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ERGIC1Q969X5 290 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 SEH1LQ96EE3 360 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 DECR2Q9NUI1 292 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 HSF4Q9ULV5 492 aa14.49□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PLCE1Q9P212 2302 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 SERPINE3A8MV23 424 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 H7C417 338 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PDCD6O75340 191 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 TNFRSF1AP19438 455 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 FUT3P21217 361 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GLRA1P23415 457 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 CHATP28329 748 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 CFHR2P36980 270 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 GATA4P43694 442 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 AP3S2P59780 193 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 IKZF1Q13422 519 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 TESK1Q15569 626 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.48□□□□□ -0.09
LRP1-210ENST00000556247 SPRNQ5BIV9 151 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms