RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IL5RAQ01344 420 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GK3PQ14409 553 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PLA1AQ53H76 456 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf88Q6PI97 169 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CD177Q8N6Q3 437 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM185AQ8NFB2 350 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SGCDQ92629 289 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 R3HDM4Q96D70 268 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PGAM5Q96HS1 289 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF488Q96MN9 340 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR10A2Q9H208 303 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR51I2Q9H344 312 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 USE1Q9NZ43 259 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 A6NDX4 124 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA2P2A6NMY6 339 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TNFRSF11BO00300 401 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SELENOFO60613 162 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ALPLP05186 524 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TFAP2AP05549 437 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IGLL1P15814 213 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MYF6P23409 242 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GLRA1P23415 457 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 COX7A1P24310 79 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SLC15A1P46059 708 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GPM6AP51674 278 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 DLX6P56179 175 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF273Q14593 569 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ICAM4Q14773 271 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 AANATQ16613 207 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CEP78Q5JTW2 689 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 KRT74Q7RTS7 529 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM219Q86XT9 240 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR8B12Q8NGG6 310 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 AQP3Q92482 292 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SDSLQ96GA7 329 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR5M11Q96RB7 305 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 INTS14Q96SY0 518 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 U3KQV3 271 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PRR32B1ATL7 298 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF732B4DXR9 585 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 XPNPEP2O43895 674 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GLCEO94923 617 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CCNB2O95067 398 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MPIG6BO95866 241 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 H2BFMP0C1H6 154 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM18P0DKX4 95 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA8P13928 327 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HCCSP53701 268 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP10-11P60412 298 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ESRRGP62508 458 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 BLCAPP62952 87 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IL18R1Q13478 541 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 BATF2Q8N1L9 274 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SETD9Q8NE22 299 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GIPC3Q8TF64 312 aa5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms