RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 LYZL4Q96KX0 146 aa15.6■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 FOXJ3Q9UPW0 622 aa15.6■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 GLP1RP43220 463 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 IL34Q6ZMJ4 242 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ROS1P08922 2347 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 COL12A1Q99715 3063 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 K7EM74 188 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 LIPCP11150 499 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CD79AP11912 226 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF32P17041 273 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CCNOP22674 350 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 RNF141Q8WVD5 230 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ISOC2Q96AB3 205 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1W2PPH5 198 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ACOT7O00154 380 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ACKR3P25106 362 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 PMELP40967 661 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 GTF3C1Q12789 2109 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC54Q8NEL0 328 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 PRO1933Q9H354 126 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.58■□□□□ 0.09
PDE4D-204ENST00000358923 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 HPNP05981 417 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 FAHP16930 419 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 PKIAP61925 76 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 C11orf87Q6NUJ2 197 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 BATF2Q8N1L9 274 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CMTM3Q96MX0 182 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 RHOFQ9HBH0 211 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CKLFQ9UBR5 152 aa15.58■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1W2PR80 420 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 RNF222A6NCQ9 220 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 SLC10A1Q14973 349 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 ACBD4Q8NC06 268 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 PGAM5Q96HS1 289 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CADP27708 2225 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 HLA-HP01893 362 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CD46P15529 392 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 TNFSF10P50591 281 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CLN3Q13286 438 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 RAB11BQ15907 218 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CHST5Q9GZS9 411 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 OR51B6Q9H340 312 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 HRH4Q9H3N8 390 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 HCKP08631 526 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF708P17019 499 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 HTR2CP28335 458 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 C10orf128Q5T292 105 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF627Q7L945 461 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 STEAP2Q8NFT2 490 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 PHYHIPQ92561 330 aa15.57■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 ARID1AO14497 2285 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 IFNA2P01563 188 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 G0S2P27469 103 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 NBL1P41271 181 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 TAS2R20P59543 309 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 RSU1Q15404 277 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 UBAC2Q8NBM4 344 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 OR8S1Q8NH09 359 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 FOXB1Q99853 325 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 GPR35Q9HC97 309 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CYTIPO60759 359 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 HOXB5P09067 269 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CALCBP10092 127 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 HOXA5P20719 270 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 GAMTQ14353 236 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 GJC3Q8NFK1 279 aa15.56■□□□□ 0.08
PDE4D-204ENST00000358923 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms