RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BIRC8Q96P09 236 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PITX2Q99697 317 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MFSD1Q9H3U5 465 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CARMIL3Q8ND23 1372 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PP18 115 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C5orf63A6NC05 138 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2AT4A6NND4 320 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC31A1O15431 190 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANGPTL7O43827 346 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF861PO60384 105 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HPGDSO60760 199 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEFHP12036 1026 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F8A1P23610 371 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HAAOP46952 286 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HBG1P69891 147 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HBG2P69892 147 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF138Q8WVD3 245 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HGDQ93099 445 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 S100PBPQ96BU1 408 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDXPQ96GD0 296 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPACA5Q96QH8 159 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEU3Q9UQ49 428 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1B0GXF2 115 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR5H1A6NKK0 313 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H3BP45 60 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHST10O43529 356 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGLV2-8P01709 118 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF19P17023 458 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL3RAP26951 378 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRSS3P35030 304 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LGALS7P47929 136 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC18A1P54219 525 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCL23P55773 120 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C16orf72Q14CZ0 275 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF212Q495C1 297 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC36A2Q495M3 483 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR5W2Q8NH69 310 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF799Q96GE5 643 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10C1Q96KK4 312 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBP7Q96R05 134 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF382Q96SR6 550 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUDT9Q9BW91 350 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TPK1Q9H3S4 243 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXL15Q9H469 300 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POMKQ9H5K3 350 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOFQ9HBH0 211 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HMG20AQ9NP66 347 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COMMD9Q9P000 198 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF222Q9UK12 451 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC42Q9Y546 428 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0U1RQV1 116 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F5H768 121 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR171O14626 319 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYTH3O43739 400 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYNGR1O43759 233 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXH1O75593 365 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 YIF1AO95070 293 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGKV3-15P01624 115 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADRB3P13945 408 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UGT2B7P16662 529 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1CAP62136 330 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAXO2Q658L1 398 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms