RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SDSL	Q96GA7	329 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511		V9GYQ6	96 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF732	B4DXR9	585 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CST4	P01036	141 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	GYPB	P06028	91 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	LPL	P06858	475 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	H2BFM	P0C1H6	154 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF20	P17024	532 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG3	P63215	75 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF273	Q14593	569 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ICAM4	Q14773	271 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF151	Q2KHN1	245 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL12	Q53G59	568 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00471	Q8N535	108 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF561	Q8N587	486 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TFAP2C	Q92754	450 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SAR1A	Q9NR31	198 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF222	Q9UK12	451 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RYR2	Q92736	4967 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NME4	O00746	187 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFAB1	O14561	156 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A2	O15244	555 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDX2	P32119	198 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	BLVRA	P53004	296 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DGCR2	P98153	550 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP78	Q5JTW2	689 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX30	Q5JUR7	227 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD2	Q86X83	199 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	STMN2	Q93045	179 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OTULIN	Q96BN8	352 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS14	Q96SY0	518 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD6	Q9BV23	337 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RASL12	Q9NYN1	266 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CD300A	Q9UGN4	299 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ODF3B	A8MYP8	253 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SPI1	P17947	270 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ACKR3	P25106	362 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	DCTD	P32321	178 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNLT3	P51808	116 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	EDDM3B	P56851	147 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN31	Q12999	210 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CRMP1	Q14194	572 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF626	Q68DY1	528 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MOB3C	Q70IA8	216 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CALHM1	Q8IU99	346 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CD177	Q8N6Q3	437 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf34	Q96L11	122 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF488	Q96MN9	340 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ASCL2	Q99929	193 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51I2	Q9H344	312 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PALMD	Q9NP74	551 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5B21	A6NL26	309 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf98	A8MV24	154 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	NXPH2	O95156	264 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFPL1	O95159	310 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNG	P01579	166 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TK1	P04183	234 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF728	P0DKX0	622 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CLU	P10909	449 aa		8.63	□□□□□ -1.03

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