RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SDHAF2Q9NX18 166 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 MED11Q9P086 117 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 COPZ2Q9P299 210 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAM28Q9UKQ2 775 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 STAP1Q9ULZ2 295 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAPPC4Q9Y296 219 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC25A15Q9Y619 301 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 U3KQV3 271 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 RYR2Q92736 4967 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ABCA4P78363 2273 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ZANQ9Y493 2812 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPRDP23468 1912 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CEP192Q8TEP8 1941 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A0G2JLM5 398 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1B0GWJ7 208 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PQLC2LA1A4F0 135 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 METTL21EPA6NDL7 271 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 OR6C70A6NIJ9 312 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SIGLEC16A6NMB1 481 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 IDSB3KWA1 339 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR89AB7ZAQ6 455 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 E5RI56 91 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 G3V2T6 193 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 TSTD3H0UI37 97 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 C19orf84I3L1E1 186 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 J3QRK9 145 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 K7ERQ8 282 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 NDUFS8O00217 210 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 NDUFA2O43678 99 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CHP2O43745 196 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 EDF1O60869 148 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 OR2B3O76000 313 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 RPP14O95059 124 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 LYPLA2O95372 231 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 AK1P00568 194 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR89BP0CG08 455 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 THRAP10827 490 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 RALBP11234 206 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 BMI1P35226 326 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 DDOSTP39656 456 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PKNOX1P55347 436 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SPCS3P61009 180 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SKP1P63208 163 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 GNA12Q03113 381 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ELP6Q0PNE2 266 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 MAB21L1Q13394 359 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 BTN1A1Q13410 526 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 MESDQ14696 234 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 QPRTQ15274 297 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 UBE2SQ16763 222 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM183BQ1AE95 376 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 RFX4Q33E94 735 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CHRFAM7AQ494W8 412 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CDNFQ49AH0 187 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 YIF1BQ5BJH7 314 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CDKL4Q5MAI5 379 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 THEM4Q5T1C6 240 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 GPRC6AQ5T6X5 926 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 LPCAT4Q643R3 524 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 TPGS2Q68CL5 300 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PRMT9Q6P2P2 845 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 AFTPHQ6ULP2 937 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 C5orf46Q6UWT4 87 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 HSDL2Q6YN16 418 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF620Q6ZNG0 422 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 UTS2BQ765I0 119 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 COMMD7Q86VX2 200 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC26A11Q86WA9 606 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PCP2Q8IVA1 136 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF695Q8IW36 515 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM183AQ8IXX5 376 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PDIK1LQ8N165 341 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 LIX1Q8N485 282 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 PACRGLQ8N7B6 248 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-206ENST00000467748 FADS6Q8N9I5 356 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms