RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF283Q8N7M2 679 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 VDAC3Q9Y277 283 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 H3BML4 177 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 STMND1H3BQB6 276 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 RER1O15258 196 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 YIF1AO95070 293 aa13.06□□□□□ -0.32
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TOP3B-206ENST00000436282 C17orf67Q0P5P2 114 aa13.06□□□□□ -0.32
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TOP3B-206ENST00000436282 LRRC18Q8N456 261 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 SUMF2Q8NBJ7 301 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PFDN5Q99471 154 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 S100A13Q99584 98 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 OPA3Q9H6K4 179 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa13.06□□□□□ -0.32
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TOP3B-206ENST00000436282 PGA3P0DJD8 388 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PIGPP57054 158 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 RNF4P78317 190 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 MFAP5Q13361 173 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 SLC16A14Q7RTX9 510 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 MUCL1Q96DR8 90 aa13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 XRCC2O43543 280 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 RD3LP0DJH9 198 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF43P17038 809 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM187Q14656 261 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PYY3Q5JQD4 70 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf152Q5JTZ5 239 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PLXDC2Q6UX71 529 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf201Q7Z4U5 140 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 UEVLDQ8IX04 471 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 SLC38A9Q8NBW4 561 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 IFITM10A6NMD0 228 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 K7N7A8 449 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 DIRAS3O95661 229 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 IL13RA2Q14627 380 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 MR1Q95460 341 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 GALNT14Q96FL9 552 aa13.05□□□□□ -0.32
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TOP3B-206ENST00000436282 CHRDQ9H2X0 955 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 NAA60Q9H7X0 242 aa13.05□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 ANXA10Q9UJ72 324 aa13.05□□□□□ -0.32
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TOP3B-206ENST00000436282 H7C1Q1 480 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 OR5H8P0DN80 308 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 S100A2P29034 98 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 GRB2P62993 217 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 TIAF1O95411 115 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 OPN1LWP04000 364 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 OR5AC1P0C628 307 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 FOSL2P15408 326 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 SP6Q3SY56 376 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 LRTM2Q8N967 370 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 EXPH5Q8NEV8 1989 aa13.04□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 MED12Q93074 2177 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 E9PLN8 166 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 HEXBP07686 556 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM225BP0DP42 221 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 HIKESHIQ53FT3 197 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PGAM5Q96HS1 289 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 LYZL4Q96KX0 146 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 PCED1AQ9H1Q7 454 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 LIME1Q9H400 295 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GV50 99 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV3-1P01715 115 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF728P0DKX0 622 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 FCGR2AP12318 317 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 GABRR1P24046 479 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP1P28562 367 aa13.03□□□□□ -0.32
TOP3B-206ENST00000436282 NHLH2Q02577 135 aa13.03□□□□□ -0.32
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