RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	STPG2	Q8N412	459 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR8U1	Q8NH10	309 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ITFG2	Q969R8	447 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPD52L3	Q96J77	140 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRRC1	Q96M27	445 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	AMELY	Q99218	206 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	COPS4	Q9BT78	406 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf21	Q9H246	121 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR51I2	Q9H344	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF732	B4DXR9	585 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651		F8VVB4	439 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651		F8VWA3	439 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	XRCC2	O43543	280 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC25A17	O43808	307 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HTR1D	P28221	377 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRABP1	P29762	137 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDOST	P39656	456 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CX3CR1	P49238	355 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	EDDM3B	P56851	147 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIGD6	Q17RP2	521 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	EPGN	Q6UW88	154 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SATL1	Q86VE3	508 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	AQP3	Q92482	292 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNJ15	Q99712	375 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAH2	Q9P225	4427 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PPE2	198 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PR64	198 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PRV1	198 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM210	A6NLX4	147 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCRL2	O00421	344 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAP30	O75446	220 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC6A1	P30531	599 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OMP	P47874	163 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	POU3F4	P49335	361 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAM2	Q15035	370 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADCK1	Q86TW2	530 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CALHM1	Q8IU99	346 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MNS1	Q8NEH6	495 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLK15	Q9H2R5	256 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR173	Q9NS66	373 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	THAP1	Q9NVV9	213 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		6.65	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PPH5	198 aa		6.64	□□□□□ -1.35

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