RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333467.3

APOBEC3B-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3B, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-201ENST00000333467 ETFDHQ16134 617 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 UEVLDQ8IX04 471 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 ARL5BQ96KC2 179 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 MFFQ9GZY8 342 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 GHRLQ9UBU3 117 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 NF1P21359 2839 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 RAB27BO00194 218 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 TTRP02766 147 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 NMBP08949 121 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 CD34P28906 385 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 BEX5Q5H9J7 111 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 LYG2Q86SG7 212 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 BIVMQ86UB2 503 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR6X1Q8NH79 312 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 C11orf40Q8WZ69 217 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 S100PBPQ96BU1 408 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRSS50Q9UI38 385 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF716A6NP11 495 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF20P17024 532 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 CCL1P22362 96 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 IL32P24001 234 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 MPGP29372 298 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR3A2P47893 321 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 CLRN1P58418 232 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 QRFPP83859 136 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 SPOCK1Q08629 439 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR8S1Q8NH09 359 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 KCNG3Q8TAE7 436 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 MITD1Q8WV92 249 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 OXGR1Q96P68 337 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 PHB2Q99623 299 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 CCL19Q99731 98 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 IFT46Q9NQC8 304 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 CENPMQ9NSP4 180 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 A0A0B4J2A0 478 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF724A8MTY0 619 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 A8MXK9 166 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 P2RY10O00398 339 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 RAMP1O60894 148 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 LYZL6O75951 148 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 APOC1P02654 83 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 FGF2P09038 288 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 HLA-DOBP13765 273 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 CD99P14209 185 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 NAT1P18440 290 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZBTB25P24278 435 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 GNALP38405 381 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 BIDP55957 195 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 DHRS2Q13268 280 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 Q6ZT83 130 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC3B-201ENST00000333467 DOK3Q7L591 496 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms