RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621181.4

CLK1-215, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLK1, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-215ENST00000621181 RAC2P15153 192 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 MYL9P24844 172 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 CTXN1P60606 82 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 FHL1Q13642 323 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 P2RY14Q15391 338 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 Q5BKY6 102 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 CPOQ8IVL8 374 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 LNX2Q8N448 690 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TMEM86BQ8N661 226 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 OR2T33Q8NG76 320 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 DYRK2Q92630 601 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 PTP4A1Q93096 173 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 FN3KQ9H479 309 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 EMC7Q9NPA0 242 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 SMIM30A4D0T7 59 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 UNC119BA6NIH7 251 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 A6NIZ1 184 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 H7C1C5 153 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 IDH3BO43837 385 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TSPAN15O95858 294 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 KRT8P05787 483 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 SFTPBP07988 381 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 MELTFP08582 738 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 IRF2P14316 349 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 SLC2A5P22732 501 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 S100A1P23297 94 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 RAP1BP61224 184 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 LCN6P62502 163 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 RAP1AP62834 184 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 CDK10Q15131 360 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 FAM201AQ5SY85 155 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 OR8G5Q8NG78 346 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 LINC01006Q8NI28 216 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TECTBQ96PL2 329 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 WACQ9BTA9 647 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 FAM183AA6NL82 134 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 F5H5P2 479 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 H0YL77 283 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 J3QW42 95 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 SC5DO75845 299 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TOX4O94842 621 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 IFI30P13284 250 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 CELP19835 753 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 IFNA8P32881 189 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 MAP2K3P46734 347 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 MTNR1BP49286 362 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 KRTAP10-3P60369 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 PYDC2Q56P42 97 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 OR2T2Q6IF00 324 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 OAFQ86UD1 273 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 GID4Q8IVV7 300 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 OR51A7Q8NH64 312 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 RASD2Q96D21 266 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 TMED9Q9BVK6 235 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 OR52D1Q9H346 318 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 RERGLQ9H628 205 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-215ENST00000621181 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.49□□□□□ -1.37
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