RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CMAHPQ9Y471 501 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 V9GYS6 101 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GTI1 187 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PPK0 400 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 C5orf63A6NC05 138 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PDCD5O14737 125 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV3-1P01715 115 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 THBS4P35443 961 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SERPINB10P48595 397 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ERVS71-1P61550 626 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 VBP1P61758 197 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SPOCK1Q08629 439 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 BAMBIQ13145 260 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OLFML2AQ68BL7 652 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PP6455Q8WZ26 134 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CENPOQ9BU64 300 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 DUSP13Q9UII6 198 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR160Q9UJ42 338 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PPW3 197 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 A6NHS1 94 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CD300LBA8K4G0 201 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CLDN34H7C241 214 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SC5DO75845 299 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 UCHL1P09936 223 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 FAHP16930 419 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SRMP19623 302 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB3AP20336 220 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RANBP1P43487 201 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MTNR1BP49286 362 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NCS1P62166 190 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CD69Q07108 199 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 INSL4Q14641 139 aa9.73□□□□□ -0.85
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR8B8Q15620 311 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2T2Q6IF00 324 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR4F5Q8NH21 305 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR51F2Q8NH61 342 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PIGCQ92535 297 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 HAVCR1Q96D42 359 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TECTBQ96PL2 329 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 POFUT1Q9H488 388 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF442Q9H7R0 627 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCB9Q9NP78 766 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CA10Q9NS85 328 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PLSCR5A0PG75 271 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MEGF11A6BM72 1044 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 A6NIN4 97 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BMQ9 156 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CDRT1O95170 752 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MPIG6BO95866 241 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NRASP01111 189 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OPN1MWP04001 364 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MAS1P04201 325 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 HCKP08631 526 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ADRA2CP18825 462 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 FSTP19883 344 aa9.72□□□□□ -0.85
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