RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	OR5M11	Q96RB7	305 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	OR8B2	Q96RD0	313 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MTOR	P42345	2549 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	FOXH1	O75593	365 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TGFA	P01135	160 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	EGR1	P18146	543 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	GLRA1	P23415	457 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	POC1A	Q8NBT0	407 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	18.79	■□□□□ 0.6	2e-9	■■■□□ 15.1
PUF60-222	ENST00000533362	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	FAM157A	C9JC47	383 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	AKR7A2	O43488	359 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	RHBDL1	O75783	438 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	HCK	P08631	526 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MKX	Q8IYA7	352 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	HIVEP2	P31629	2446 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	WNT2	P09544	360 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	HSMCR30	P0CW71	290 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PGA5	P0DJD9	388 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	NPY4R	P50391	375 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TRAM1	Q15629	374 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362		Q8IYB0	196 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	NLK	Q9UBE8	527 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	LRRC42	Q9Y546	428 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362		A8MXK9	166 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF879	B4DU55	563 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	PITPNB	P48739	271 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	GNB2	P62879	340 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	CALHM1	Q8IU99	346 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	FCGR1B	Q92637	280 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM186	Q96B77	213 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM160	Q9NX00	188 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	CLN8	Q9UBY8	286 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ADAM20	O43506	726 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	SYNGR1	O43759	233 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	NXPH2	O95156	264 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	GYPA	P02724	150 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	FST	P19883	344 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	GATA3	P23771	443 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	MAP2K4	P45985	399 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	POU3F4	P49335	361 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	GMFB	P60983	142 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	TPBG	Q13641	420 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF529	Q6P280	563 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	CEP19	Q96LK0	163 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	OR14A2	Q96R54	314 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	MGLL	Q99685	303 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ALDOB	P05062	364 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	STUM	Q69YW2	141 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF773	Q6PK81	442 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	RHOF	Q9HBH0	211 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PUF60-222	ENST00000533362	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		18.74	■□□□□ 0.59

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