RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479495.5

QARS-215, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-215	ENST00000479495	SKA3	Q8IX90	412 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	DYRK2	Q92630	601 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	C4orf45	Q96LM5	186 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	WDFY2	Q96P53	400 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	C1orf198	Q9H425	327 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	RNF121	Q9H920	327 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	POLE4	Q9NR33	117 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	LRP12	Q9Y561	859 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		7.55	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ZNF879	B4DU55	563 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495		J3QRK9	145 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	OPN1MW	P04001	364 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	H2BFM	P0C1H6	154 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CD40LG	P29965	261 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	TNFSF8	P32971	234 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	KIR3DL2	P43630	455 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ZNF84	P51523	738 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	BPIFB3	P59826	476 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495		Q499Y3	187 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	WDR38	Q5JTN6	314 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	GPR157	Q5UAW9	335 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	MZT2A	Q6P582	158 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CCDC190	Q86UF4	302 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	THRSP	Q92748	146 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CEP19	Q96LK0	163 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	OR14A2	Q96R54	314 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ATF6B	Q99941	703 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	EMC7	Q9NPA0	242 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495		R4GMQ9	66 aa		7.54	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	PDCD5	O14737	125 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	TMEM127	O75204	238 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	MELTF	P08582	738 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	SRM	P19623	302 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	RAB3B	P20337	219 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	MSR1	P21757	451 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CDA	P32320	146 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	MMP15	P51511	669 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CAV3	P56539	151 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	PPP3R1	P63098	170 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	PLP2	Q04941	152 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	SGCA	Q16586	387 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CORO6	Q6QEF8	472 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	GPR148	Q8TDV2	347 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	DERL3	Q96Q80	235 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	NIPAL2	Q9H841	368 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ABCB9	Q9NP78	766 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	CENPM	Q9NSP4	180 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		7.53	□□□□□ -1.2
QARS-215	ENST00000479495	COL7A1	Q02388	2944 aa		7.52	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms