RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471308.5

PCBP4-208, Transcript of poly(rC) binding protein 4, human

TSL 2

Gene PCBP4, Length 2,087 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP4-208	ENST00000471308	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	LNP1	A1A4G5	178 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	HTR3B	O95264	441 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	NRAS	P01111	189 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	CCDC157	Q569K6	752 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PXT1	Q8NFP0	134 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	OR2M7	Q8NG81	312 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	ABHD3	Q8WU67	409 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	OR8B8	Q15620	311 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	GLRX5	Q86SX6	157 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SLC39A7	Q92504	469 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	CCDC120	Q96HB5	630 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	LOXL4	Q96JB6	756 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	FAM117A	Q9C073	453 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	IL36G	Q9NZH8	169 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	NEURL1	O76050	574 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	DTYMK	P23919	212 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SPINK14	Q6IE38	97 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SKA3	Q8IX90	412 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	BVES	Q8NE79	360 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	DCUN1D4	Q92564	292 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	CYYR1	Q96J86	154 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PRELID1	Q9Y255	219 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PATE4	P0C8F1	98 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SP9	P0CG40	484 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PET100	P0DJ07	73 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PGAM2	P15259	253 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PI3	P19957	117 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	FUT6	P51993	359 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	FAM3A	P98173	230 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	MOB3C	Q70IA8	216 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	SPSB4	Q96A44	273 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PCBP4-208	ENST00000471308	COL6A3	P12111	3177 aa		14.71	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	F10	P00742	488 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	LHX2	P50458	406 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	STOML3	Q8TAV4	291 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	LINC00052	Q96N35	136 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	ANGPTL7	O43827	346 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	LYL1	P12980	280 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	BEX5	Q5H9J7	111 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF75A	Q96N20	296 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	DECR2	Q9NUI1	292 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	MEMO1	Q9Y316	297 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	RTTN	Q86VV8	2226 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	BET1	O15155	118 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	GLRA1	P23415	457 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	CHAT	P28329	748 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF92	Q03936	586 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	TAF9	Q16594	264 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PCBP4-208	ENST00000471308	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		14.69	□□□□□ -0.06

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