RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRF-211ENST00000467464 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRF-211ENST00000467464 HES4Q9HCC6 221 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRF-211ENST00000467464 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRF-211ENST00000467464 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRF-211ENST00000467464 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRF-211ENST00000467464 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRF-211ENST00000467464 AP4S1Q9Y587 144 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRF-211ENST00000467464 MEGF11A6BM72 1044 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 DLGAP1O14490 977 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 CRYBA1P05813 215 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 FBP1P09467 338 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 FASP25445 335 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 SAA4P35542 130 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 GABRA2P47869 451 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ISL1P61371 349 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ERVK11-1P61568 191 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 EGR3Q06889 387 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 OCLNQ16625 522 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZSV7 163 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 GID4Q8IVV7 300 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 GPR173Q9NS66 373 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 RASL12Q9NYN1 266 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 A6NIN4 97 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 E9PQ18 207 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 CLPXO76031 633 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 APOL3O95236 402 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 HTR1FP30939 366 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 HAAOP46952 286 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF573Q86YE8 665 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 CALHM1Q8IU99 346 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 TBX5Q99593 518 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 C16orf95Q9H693 158 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 RNF114Q9Y508 228 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PQ09 198 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 TSPAN9O75954 239 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 PRDX2P32119 198 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 KIR3DL2P43630 455 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 DLX6P56179 175 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ACSM1Q08AH1 577 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 UBE2V2Q15819 145 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 MKXQ8IYA7 352 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 BATF2Q8N1L9 274 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF561Q8N587 486 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 RORBQ92753 470 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 EME1Q96AY2 570 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 MEIOCA2RUB1 952 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 F8VVB4 439 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 F8VWA3 439 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 RPP14O95059 124 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 OR2T7P0C7T2 308 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 FCGR1AP12314 374 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ERVFRD-1P60508 538 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF85Q03923 595 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 IL24Q13007 206 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF273Q14593 569 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 MIDNQ504T8 468 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 BRICD5Q6PL45 260 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 ASRGL1Q7L266 308 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-211ENST00000467464 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.74□□□□□ -0.85
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