RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	PLPP2	O43688	288 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SERPINA3	P01011	423 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	GRP	P07492	148 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	GNAO1	P09471	354 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	PITPNB	P48739	271 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	GPM6A	P51674	278 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	PAX2	Q02962	417 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	RNLS	Q5VYX0	342 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	LRRC29	Q8WV35	223 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	NRG4	Q8WWG1	115 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SPSB1	Q96BD6	273 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	TMEM80	Q96HE8	168 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	RNF170	Q96K19	258 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	BEX2	Q9BXY8	128 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	PKIB	Q9C010	78 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	RASL12	Q9NYN1	266 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	AASS	Q9UDR5	926 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ZNF732	B4DXR9	585 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128		J3QLW9	94 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128		J3QT63	122 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ZFPL1	O95159	310 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	IFNA2	P01563	188 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	MT-ND2	P03891	347 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ZNF19	P17023	458 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SRD5A1	P18405	259 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	FUT6	P51993	359 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	AQP4	P55087	323 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	TAS2R43	P59537	309 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	GNB2	P62879	340 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	BDH1	Q02338	343 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	IL24	Q13007	206 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	CEP78	Q5JTW2	689 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	CD276	Q5ZPR3	534 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	STUM	Q69YW2	141 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	POC1A	Q8NBT0	407 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	AQP3	Q92482	292 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	THRSP	Q92748	146 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SMIM19	Q96E16	107 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	RHOF	Q9HBH0	211 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	NEK6	Q9HC98	313 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	CLN8	Q9UBY8	286 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		6.96	□□□□□ -1.29
USP34-208	ENST00000467128	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	ATP6V1G2	O95670	118 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	FSHB	P01225	129 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	CD1A	P06126	327 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	LIPF	P07098	398 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	PGA5	P0DJD9	388 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	ZNF20	P17024	532 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	EGR1	P18146	543 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	PRKACB	P22694	351 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	MYF6	P23409	242 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	HAAO	P46952	286 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	RBP2	P50120	134 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	ETV1	P50549	477 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	ACSM1	Q08AH1	577 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	ST3GAL4	Q11206	333 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	CDK5R1	Q15078	307 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	UBE2V2	Q15819	145 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	FAM201A	Q5SY85	155 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP34-208	ENST00000467128	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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