RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 SLC35B1P78383 322 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 KRT72Q14CN4 511 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 MAPRE2Q15555 327 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 GFOD2Q3B7J2 385 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 POC1AQ8NBT0 407 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 DPM3Q9P2X0 92 aa11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 K7N7A8 449 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 CCL24O00175 119 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 CXCR6O00574 342 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 GSTA4O15217 222 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ACKR3P25106 362 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 OR3A4PP47883 348 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZBTB9Q96C00 473 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZNF714Q96N38 554 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 NDUFAF4Q9P032 175 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.88□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 JTBO76095 146 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SERPINA1P01009 418 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 AMY1AP04745 511 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 AMY2AP04746 511 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 MAP2K3P46734 347 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 INSL3P51460 131 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 C9orf152Q5JTZ5 239 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZNF329Q86UD4 541 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 OR8U1Q8NH10 309 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 LYZL4Q96KX0 146 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 OR8B4Q96RC9 309 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 FUZQ9BT04 418 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.87□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SORL1Q92673 2214 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 hADV38S2A0JD32 116 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 LEUTXA8MZ59 168 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 PSKH1P11801 424 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 PIPP12273 146 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ATP6V1B1P15313 513 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 RAB25P57735 213 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SHFQ7M4L6 423 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZNF676Q8N7Q3 588 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZNF511Q8NB15 262 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 OR52J3Q8NH60 311 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZNF596Q8TC21 504 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 CDRT15Q96T59 188 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 NIPAL2Q9H841 368 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 BRD7Q9NPI1 651 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SCOCQ9UIL1 159 aa11.86□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 NXPH2O95156 264 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 H2BFMP0C1H6 154 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 FAM106CPP0CH98 169 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 CEACAM3P40198 252 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 OPRL1P41146 370 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 BDH1Q02338 343 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 KIR2DS1Q14954 304 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 SNAPC1Q16533 368 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 OR52W1Q6IF63 320 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ZNF573Q86YE8 665 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ISOC1Q96CN7 298 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 RAX2Q96IS3 184 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 ABHD6Q9BV23 337 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.85□□□□□ -0.51
NELFE-204ENST00000436289 HHLA2Q9UM44 414 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms