RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378078.4

RGP1-201, Transcript of RGP1 homolog, RAB6A GEF complex partner 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RGP1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1-201ENST00000378078 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.61□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.61□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 GPX8Q8TED1 209 aa14.61□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.61□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 OR2A2Q6IF42 318 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 DERL3Q96Q80 235 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 E5RGE8 158 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 FABP5Q01469 135 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ABHD3Q8WU67 409 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ACER3Q9NUN7 267 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 NSG2Q9Y328 171 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TPBGQ13641 420 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 OR10D3Q8NH80 312 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 KLK11Q9UBX7 282 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ETHE1O95571 254 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 GNG4P50150 75 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 GABRG3Q99928 467 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TRIP11Q15643 1979 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 PPICP45877 212 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 EGR3Q06889 387 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TCFL5Q9UL49 500 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ARRB2P32121 409 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ERVS71-1P61550 626 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 PPP1CAP62136 330 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.6□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TGOLN2O43493 480 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 MAGEA5P43359 124 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 MOGAT3Q86VF5 341 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ACSM4P0C7M7 580 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TEX261Q6UWH6 196 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 FAM219AQ8IW50 185 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 CIDEAO60543 219 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TTRP02766 147 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 CHRNA7P36544 502 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 P2RX4Q99571 388 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 M0R296 226 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 PRSS1P07477 247 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 HIST1H3AP68431 136 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 INSL4Q14641 139 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 VAMP8Q9BV40 100 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 PSMB6P28072 239 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 RRN3P1Q2M238 152 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 AFMIDQ63HM1 303 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 RND1Q92730 232 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.59□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 JTBO76095 146 aa14.58□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.58□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.58□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 ST8SIA5O15466 376 aa14.58□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
RGP1-201ENST00000378078 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 A1L4Q6 167 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 TNFRSF10CO14798 259 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 PHOX2AO14813 284 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 FZD6O60353 706 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 EML2O95834 649 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 VSIG4Q9Y279 399 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 DHHO43323 396 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 VAMP5O95183 116 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 ACP1P24666 158 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 WNT5AP41221 380 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 C4orf45Q96LM5 186 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 DHODHQ02127 395 aa14.58□□□□□ -0.08
RGP1-201ENST00000378078 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms