RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.08■■□□□ 1.13
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C9orf40-201ENST00000376854 TNFSF11O14788 317 aa22.08■■□□□ 1.12
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C9orf40-201ENST00000376854 CHAF1BQ13112 559 aa22.07■■□□□ 1.12
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C9orf40-201ENST00000376854 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.07■■□□□ 1.12
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C9orf40-201ENST00000376854 DEDDO75618 318 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf40-201ENST00000376854 CST4P01036 141 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf40-201ENST00000376854 NPBWR1P48145 328 aa22.03■■□□□ 1.12
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C9orf40-201ENST00000376854 SH2D2AQ9NP31 389 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF581Q9P0T4 197 aa22.03■■□□□ 1.12
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