RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 OR2T27Q8NH04 317 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.54□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.54□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 J3QT63 122 aa14.54□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 NPFFO15130 113 aa14.54□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 PGA5P0DJD9 388 aa14.54□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 MPZP25189 248 aa14.54□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 OCLNQ16625 522 aa14.54□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.54□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.54□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.54□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.53□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.53□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 HES4Q9HCC6 221 aa14.53□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.53□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.53□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.53□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 METTL15A6NJ78 407 aa14.52□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 PRDX2P32119 198 aa14.52□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.52□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 SSX6Q7RTT6 188 aa14.52□□□□□ -0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 CD177Q8N6Q3 437 aa14.52□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.52□□□□□ -0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 GPR173Q9NS66 373 aa14.52□□□□□ -0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.51□□□□□ -0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 C16orf95Q9H693 158 aa14.51□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.51□□□□□ -0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 EME1Q96AY2 570 aa14.5□□□□□ -0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 RNF114Q9Y508 228 aa14.5□□□□□ -0.09
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HDDC3-201ENST00000330334 A0A1W2PPE2 198 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 A0A1W2PR64 198 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 A0A1W2PRV1 198 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 SYT7O43581 403 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 TSPAN9O75954 239 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 TGFBR2P37173 567 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 CAPZA1P52907 286 aa14.49□□□□□ -0.09
HDDC3-201ENST00000330334 DLX1P56177 255 aa14.49□□□□□ -0.09
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