RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 PHYHIPQ92561 330 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ITFG2Q969R8 447 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A28Q96A46 364 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CKLFQ9UBR5 152 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 LYSTQ99698 3801 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 DPPA5A6NC42 116 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 DHRS3O75911 302 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NGFP01138 241 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SELEP16581 610 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NR4A1P22736 598 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OMGP23515 440 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 GIFP27352 417 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CALCRP30988 508 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 GNALP38405 381 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 WNT5AP41221 380 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 FABP5Q01469 135 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SGK3Q96BR1 496 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 KCTD7Q96MP8 289 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR14A2Q96R54 314 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR51E2Q9H255 320 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 BEX1Q9HBH7 125 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NEK6Q9HC98 313 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 STARD10Q9Y365 291 aa9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BSA7 217 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ICMTO60725 284 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 GABARAPO95166 117 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MSMBP08118 114 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 GLRXP35754 106 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 DDOSTP39656 456 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CRYBB2P43320 205 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP3R1P63098 170 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF92Q03936 586 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 C22orf42Q6IC83 251 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 VHLLQ6RSH7 139 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM106AQ96A25 262 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ISOC1Q96CN7 298 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 C10orf35Q96D05 121 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 LPAR2Q9HBW0 351 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 PLXNB1O43157 2135 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC22A1O15245 554 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGEB3O15480 346 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 GPX5O75715 221 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 AVPP01185 164 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 RAC2P15153 192 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CCL1P22362 96 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 GSK3AP49840 483 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM3AP98173 230 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 MOGQ16653 247 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NUP37Q8NFH4 326 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NANPQ8TBE9 248 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 SPSB4Q96A44 273 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 FGGYQ96C11 551 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 CMBLQ96DG6 245 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 LYZL4Q96KX0 146 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 DERL3Q96Q80 235 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 NOX4Q9NPH5 578 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.7 ms