RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.92□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.92□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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TOP3A-217ENST00000584582 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.91□□□□□ -0.82
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TOP3A-217ENST00000584582 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 TAAR9Q96RI9 348 aa9.91□□□□□ -0.82
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TOP3A-217ENST00000584582 FAM189A2Q15884 450 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
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TOP3A-217ENST00000584582 U3KQA8 63 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 M0R296 226 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 ANOS1P23352 680 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 LYG2Q86SG7 212 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 SLAMF9Q96A28 289 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 MEMO1Q9Y316 297 aa9.91□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 ABCA1O95477 2261 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 SERPINA7P05543 415 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 RRASP10301 218 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 CD46P15529 392 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 FCGR2CP31995 323 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.9□□□□□ -0.82
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TOP3A-217ENST00000584582 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.9□□□□□ -0.82
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TOP3A-217ENST00000584582 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.9□□□□□ -0.82
TOP3A-217ENST00000584582 WDR54Q9H977 334 aa9.9□□□□□ -0.82
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TOP3A-217ENST00000584582 A0A087WZY1 265 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOP3A-217ENST00000584582 RAG2P55895 527 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 PCBD1P61457 104 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 SLC10A1Q14973 349 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 OR2T2Q6IF00 324 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 MKXQ8IYA7 352 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 OR51H1Q8NH63 302 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 FBXW5Q969U6 566 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 SGK3Q96BR1 496 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOP3A-217ENST00000584582 E9PLN8 166 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 CD1AP06126 327 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 CLINT1Q14677 625 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOP3A-217ENST00000584582 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 SKA3Q8IX90 412 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOP3A-217ENST00000584582 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOP3A-217ENST00000584582 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1B0GTI1 187 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 PINLYPA6NC86 204 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOP3A-217ENST00000584582 LYZL6O75951 148 aa9.89□□□□□ -0.83
TOP3A-217ENST00000584582 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
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