RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 A0A087WZ39 114 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 A0A0A6YYH2 397 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 A6NJ64 397 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 A8MVM7 634 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 K7ERQ8 282 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SULT2B1O00204 365 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 WRBO00258 174 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CDC42EP2O14613 210 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 PHYHO14832 338 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ARPC5O15511 151 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TBL1XO60907 577 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SH3BGRLO75368 114 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CEACAM4O75871 244 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TOXO94900 526 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SLC2A10O95528 541 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 POP4O95707 220 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 AK1P00568 194 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 IGHEP01854 428 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CRYBA1P05813 215 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 FABP1P07148 127 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 FBP1P09467 338 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SLC2A1P11166 492 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CD52P31358 61 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 HSD17B2P37059 387 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 HCCSP53701 268 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CASP9P55211 416 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 UCP2P55851 309 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R41P59536 307 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R20P59543 309 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 MADCAM1Q13477 382 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CRMP1Q14194 572 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZIC1Q15915 447 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ARL9Q6T311 187 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 LRRTM1Q86UE6 522 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 PARGQ86W56 976 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SERPINA12Q8IW75 414 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TDHQ8IZJ6 230 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZNF614Q8N883 585 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TMEM229BQ8NBD8 167 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 OR5J2Q8NH18 312 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 GPX8Q8TED1 209 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 THRSPQ92748 146 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 RAB8BQ92930 207 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 GLYATL1Q969I3 302 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TMEM159Q96B96 161 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 FAHD2AQ96GK7 314 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SLC41A3Q96GZ6 507 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 C4orf36Q96KX1 117 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZNF681Q96N22 645 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 DERL3Q96Q80 235 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 RASL10BQ96S79 203 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 PDCD10Q9BUL8 212 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 APMAPQ9HDC9 416 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 MMP26Q9NRE1 261 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 SPG21Q9NZD8 308 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CNIH4Q9P003 139 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 MLXQ9UH92 298 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 V9GY05 133 aa4.19□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 C9orf170A2RU37 121 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 A6NIN4 97 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 EFCAB7A8K855 629 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 DISC1C4P0D8 188 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 NPIPB9F8W1W9 429 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 GPR31O00270 319 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ARPC3O15145 178 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 EMC8O43402 210 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 RAD51DO75771 328 aa4.18□□□□□ -1.74
TRDN-204ENST00000542443 ACTL6AO96019 429 aa4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms