RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM163	Q8TC26	289 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	APOL4	Q9BPW4	351 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TEX12	Q9BXU0	123 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MRO	Q9BYG7	248 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NLK	Q9UBE8	527 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GUS0	222 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5B21	A6NL26	309 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	DHRS3	O75911	302 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CXCR4	P61073	352 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TAF9	Q16594	264 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PNKD	Q8N490	385 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	POC1A	Q8NBT0	407 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4F5	Q8NH21	305 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	DYRK2	Q92630	601 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SDSL	Q96GA7	329 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MED30	Q96HR3	178 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	AJUBA	Q96IF1	538 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CITED1	Q99966	193 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KRT84	Q9NSB2	600 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		V9GYS6	101 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R1W7	72 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KCNAB3	O43448	404 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KNG1	P01042	644 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CCL1	P22362	96 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GLRA1	P23415	457 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CD177	Q8N6Q3	437 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF488	Q96MN9	340 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MNT	Q99583	582 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	BEX1	Q9HBH7	125 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CLN6	Q9NWW5	311 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		R4GMQ9	66 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1W2PRD5	423 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1W2PRF3	423 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1W2PRM7	423 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		G3V2T6	193 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		J3QT63	122 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NPFF	O15130	113 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SYNGR1	O43759	233 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NRAS	P01111	189 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PGA5	P0DJD9	388 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NDUFB7	P17568	137 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MPZ	P25189	248 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2E1	P51965	193 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PROK1	P58294	105 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GUCA2A	Q02747	115 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TREML4	Q6UXN2	200 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MOB3C	Q70IA8	216 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	COMMD2	Q86X83	199 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC01006	Q8NI28	216 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	C17orf50	Q8WW18	174 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CIB1	Q99828	191 aa		9.78	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		9.78	□□□□□ -0.84

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