RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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HDDC3-201ENST00000330334 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 GLRA1P23415 457 aa14.59□□□□□ -0.07
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HDDC3-201ENST00000330334 DGUOKQ16854 277 aa14.59□□□□□ -0.07
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HDDC3-201ENST00000330334 Q8N7P7 452 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 AQP3Q92482 292 aa14.59□□□□□ -0.07
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HDDC3-201ENST00000330334 C1RLQ9NZP8 487 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC3-201ENST00000330334 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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HDDC3-201ENST00000330334 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.58□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 PSG2P11465 335 aa14.58□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 COMMD2Q86X83 199 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.58□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 SDSLQ96GA7 329 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 APOL4Q9BPW4 351 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.58□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 ZNF222Q9UK12 451 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 V9GYS6 101 aa14.58□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.57□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.57□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 A0A1B0GTI1 187 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 FBP1P09467 338 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 OMGP23515 440 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 UBE2E1P51965 193 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 RELBQ01201 579 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 TMED1Q13445 227 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.56□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.56□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 SULT1C4O75897 302 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 KNG1P01042 644 aa14.55□□□□□ -0.08
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HDDC3-201ENST00000330334 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.55□□□□□ -0.08
HDDC3-201ENST00000330334 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.55□□□□□ -0.08
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