RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 FBXO17Q96EF6 278 aa15.17■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 C14orf79Q96F83 325 aa15.17■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 KIRREL1Q96J84 757 aa15.17■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.17■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 GLI4P10075 376 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 NAT2P11245 290 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 PRF1P14222 555 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 CBR1P16152 277 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 ECH1Q13011 328 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 SP6Q3SY56 376 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 SLC25A45Q8N413 288 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 ADAMTS20P59510 1910 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 PQLC2LA1A4F0 135 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF726A6NNF4 738 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 CST4P01036 141 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 FHITP49789 147 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 RRADP55042 308 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 HIST3H3Q16695 136 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 SULF2Q8IWU5 870 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 RNF138Q8WVD3 245 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 C1orf123Q9NWV4 160 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 MEMO1Q9Y316 297 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 DEDDO75618 318 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 GLAP06280 429 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 CPT2P23786 658 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 OR2M3Q8NG83 312 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 CACFD1Q9UGQ2 172 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 SDK2Q58EX2 2172 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 TAAR5O14804 337 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 ANGPTL7O43827 346 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 NME2P1O60361 137 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 ADH6P28332 368 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 OPRM1P35372 400 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 HGFACQ04756 655 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 DYRK2Q92630 601 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 OXGR1Q96P68 337 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 PRRX2Q99811 253 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 IFT22Q9H7X7 185 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 PARP11Q9NR21 331 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 MYOTQ9UBF9 498 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4A-201ENST00000293683 SERPINE3A8MV23 424 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF84P51523 738 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 NAXEQ8NCW5 288 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 TOMM40LQ969M1 308 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 ISOC2Q96AB3 205 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 XRCC2O43543 280 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 C1QL1O75973 258 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM225BP0DP42 221 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 DAOP14920 347 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 THBS4P35443 961 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 BRICD5Q6PL45 260 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 WDSUB1Q8N9V3 476 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 S100A13Q99584 98 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 DHRS3O75911 302 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 DIRAS3O95661 229 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 IGLV3-1P01715 115 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 GLB1P16278 677 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 CHAF1BQ13112 559 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 MIDNQ504T8 468 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 C20orf196Q8IYI0 205 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 AQP7P3A6NL99 342 aa15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PDE4A-201ENST00000293683 KCNMB1Q16558 191 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms