RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.8□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 P2RY10O00398 339 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 AIREO43918 545 aa9.8□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.79□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 Q499Y3 187 aa9.79□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.79□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF35P13682 527 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 GALP22466 123 aa9.78□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 MYL9P24844 172 aa9.78□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 MAP2K3P46734 347 aa9.78□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CASC10Q5T4H9 136 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 C1QL2Q7Z5L3 287 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 RDH10Q8IZV5 341 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 FTMTQ8N4E7 242 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.78□□□□□ -0.84
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