RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 BDH1Q02338 343 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 MVKQ03426 396 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 IRF3Q14653 427 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CDK5R1Q15078 307 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 C6orf183Q5T699 404 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR5AS1Q8N127 324 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 RDH5Q92781 318 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 NEURL2Q9BR09 285 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 MND1Q9BWT6 205 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 DIABLOQ9NR28 239 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PTGES3LE9PB15 166 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OGG1O15527 345 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 SYT7O43581 403 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 RGS10O43665 173 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 HPXP02790 462 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LYNX1P0DP58 116 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 GNALP38405 381 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PSMB10P40306 273 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CDH15P55291 814 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CCL8P80075 99 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 SLC3A1Q07837 685 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR8G1Q15617 311 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TMEM42Q69YG0 159 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 COMMD2Q86X83 199 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 SMIM19Q96E16 107 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TECTBQ96PL2 329 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR2V2Q96R30 315 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 SOX7Q9BT81 388 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CHODLQ9H9P2 273 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TMEM160Q9NX00 188 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 HHLA2Q9UM44 414 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LRP5LA4QPB2 252 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TMEM210A6NLX4 147 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ANXA2P2A6NMY6 339 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 P2RY10O00398 339 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PLPP2O43688 288 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LMX1BO60663 402 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 RP2O75695 350 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ZFPL1O95159 310 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 FSTL3O95633 263 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CRYZL1O95825 349 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CA6P23280 308 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 COL8A2P25067 703 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PRSS12P56730 875 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TMEM33P57088 247 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 MAB21L1Q13394 359 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 RIN1Q13671 783 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 HFEQ30201 348 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 FAM76BQ5HYJ3 339 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 SLC51BQ86UW2 128 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 Q8TCH9 128 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PP6455Q8WZ26 134 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TRIM63Q969Q1 353 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 GCM1Q9NP62 436 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms