RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ALDH3B2P48448 385 aa9.83□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 MALLQ13021 153 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 TPBGQ13641 420 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR38Q5JTN6 314 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 FDX2Q6P4F2 183 aa9.83□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.83□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.83□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 THRSPQ92748 146 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 C4orf45Q96LM5 186 aa9.83□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAM206AQ9NX38 181 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GUS0 222 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 E9PI62 339 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 J3QW42 95 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 XRCC2O43543 280 aa9.82□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 LALBAP00709 142 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 HLA-DPB1P04440 258 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CD1AP06126 327 aa9.82□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 CCL2P13500 99 aa9.82□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 GABRA5P31644 462 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 RAD52P43351 418 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ODF4Q2M2E3 257 aa9.82□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 SATL1Q86VE3 508 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 GHSRQ92847 366 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 RGCCQ9H4X1 137 aa9.82□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.82□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 SYT7O43581 403 aa9.81□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 PNPP00491 289 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV1-44P01699 117 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CD2P06729 351 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CELA3BP08861 270 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 PTAFRP25105 342 aa9.81□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 LIPAP38571 399 aa9.81□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.81□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 ABHD4Q8TB40 342 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR148Q8TDV2 347 aa9.81□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 OPA3Q9H6K4 179 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.81□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 HHLA2Q9UM44 414 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 STUB1Q9UNE7 303 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0U1RQV5 110 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.8□□□□□ -0.84
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