RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A6NJ64 397 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAD1O00515 517 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYL12BO14950 172 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CA11O75493 328 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYO1DO94832 1006 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGKV1D-16P01601 117 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCHEP06276 602 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCN2P20062 427 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OMGP23515 440 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBE2AP49459 152 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VEGFCP49767 419 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPOXP50336 477 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF136P52737 540 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BLVRAP53004 296 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PITPNAQ00169 270 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KDSRQ06136 332 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INCA1Q0VD86 236 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IDNKQ5T6J7 187 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OTPQ5XKR4 325 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF774Q6NX45 483 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM151BQ6UXP7 276 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LGI3Q8N145 548 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR5AK3PQ8NH89 298 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAAR1Q96RJ0 339 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFR2Q9UP52 801 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELP1O95163 1332 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADCY9O60503 1353 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRBV12-3P01733 135 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CXCR1P25024 350 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB38P57729 211 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAS2R31P59538 309 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD164Q04900 197 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERCC8Q13216 396 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C6orf99Q4VX62 202 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC32Q5I0X7 151 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HHATQ5VTY9 493 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAPTQ8N292 157 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR51Q1Q8NH59 317 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR1S1Q8NH92 325 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBA3Q8TBC4 463 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABHD3Q8WU67 409 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDS1Q92903 461 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TM4SF18Q96CE8 201 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RDH14Q9HBH5 336 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL17CQ9P0M4 197 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A6NDX4 124 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPZL2O60487 215 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RP2O75695 350 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APLNRP35414 380 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNB2P62879 340 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARG2P78540 354 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MADCAM1Q13477 382 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHHQ15465 462 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDNFQ49AH0 187 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AVPI1Q5T686 147 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPICQ8N5J4 248 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q8N9W7 124 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10G6Q8NH81 332 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GHSRQ92847 366 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITFG2Q969R8 447 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR34Q96EX3 536 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms