RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRX2	142 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EIL1	84 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT8	O14734	319 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF682	O95780	498 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	REN	P00797	406 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFB7	P17568	137 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	KDELR2	P33947	212 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	BMX	P51813	675 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A2	P52569	658 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOW	P63302	87 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N7P7	452 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5M11	Q96RB7	305 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	B9D1	Q9UPM9	204 aa		8.8	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511		E9PQ18	207 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R1W7	72 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R3D	O95685	299 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	LHB	P01229	141 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF823	P16415	610 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF13	Q15543	124 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	RFX4	Q33E94	735 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	FGD3	Q5JSP0	725 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf50	Q8WW18	174 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF14	Q92956	283 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ADA2	Q9NZK5	511 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	TENM3	Q9P273	2699 aa		8.79	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	DCTN6	O00399	190 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	GLCE	O94923	617 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SELL	P14151	372 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX6	P26367	422 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAL	P38405	381 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALS4	P56470	323 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK2B	P67870	215 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35A2	P78381	396 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6V1	Q8N148	313 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T12	Q8NG77	320 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	DPF1	Q92782	380 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SEH1L	Q96EE3	360 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	MED30	Q96HR3	178 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	NMNAT3	Q96T66	252 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	COPS4	Q9BT78	406 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	OPA3	Q9H6K4	179 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		8.78	□□□□□ -1
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC119B	A6NIH7	251 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CDIPT	O14735	213 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	MRAS	O14807	208 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	FFAR1	O14842	300 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST1	O43916	411 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	TIPRL	O75663	272 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT34	O76011	436 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	DDOST	P39656	456 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRA2	P47869	451 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKX	P51817	358 aa		8.77	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	AANAT	Q16613	207 aa		8.77	□□□□□ -1.01

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