RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641733.1

CASC19-255, Transcript of cancer susceptibility 19, human

BASIC

Gene CASC19, Length 1,385 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-255	ENST00000641733	STX4	Q12846	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	KYAT1	Q16773	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	STX12	Q86Y82	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	MEIS3	Q99687	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	MYH8	P13535	1937 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733		A0A1B0GU03	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733		E9PAM4	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SNAP91	O60641	907 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SNAP29	O95721	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ACTL6A	O96019	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SERPINA6	P08185	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SELENOT	P62341	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	PSG5	Q15238	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ESR2	Q92731	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	FGF14	Q92915	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	DSN1	Q9H410	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733		A6NIZ1	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	NME4	O00746	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	OR5F1	O95221	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	APOE	P02649	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	PSKH1	P11801	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	HLA-G	P17693	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	MAG	P20916	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CXCR2	P25025	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	EVI2B	P34910	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SERPINB5	P36952	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ACTR1B	P42025	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CSRP3	P50461	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	HCCS	P53701	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	RAP1B	P61224	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	DR1	Q01658	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	FGGY	Q96C11	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	REEP1	Q9H902	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	JPT2	Q9H910	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-255	ENST00000641733	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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