RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr66F8VQ01 311 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm16434J3QN10 205 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PhyhO35386 338 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccl20O89093 97 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cpt2P52825 658 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wbp1P97764 304 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hsf5Q5ND04 624 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tas2r107Q7M725 308 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Oxa1lQ8BGA9 433 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ldlrad4Q8BWJ4 306 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gpat4Q8K2C8 456 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ApehQ8R146 732 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr800Q8VFH7 311 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mageh1Q9NWG9 218 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slco1a1Q9QXZ6 670 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Anxa10Q9QZ10 324 aa20.2■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4931422A03RikA2BHN9 113 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Macc1E9PXX8 851 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21767J3QPV5 180 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm10881P01642 115 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gpr83P30731 423 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sox18P43680 377 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r231Q8R2A3 311 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r59Q8R2B9 310 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr919Q8VF78 315 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr410Q8VFX7 315 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr402Q8VFX8 315 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PsphQ99LS3 225 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Brca2P97929 3329 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ighv15-2A0A0A6YX72 118 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Scgb1b30A2BH64 92 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 IqckD3YYL3 290 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm6465F7A7Y6 181 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Obox6G3X9U1 347 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rap1aP62835 184 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ly6eQ64253 130 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc35e4Q8K3D6 351 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nt5dc2Q91X76 390 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 QprtQ91X91 299 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rap1bQ99JI6 184 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnih4Q9CX13 139 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arl5bQ9D4P0 179 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 EurlQ9D7G4 290 aa20.19■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1018A2ASV3 311 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf148G3X9R7 316 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Grap2O89100 322 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Il5raP21183 415 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pax2P32114 414 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AdmP97297 184 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Taar8cQ5QD05 344 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 2210407C18RikQ6YI28 220 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp790Q80ZX2 779 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Defb21Q8C5Z4 100 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp1r3bQ8C767 284 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sav1Q8VEB2 386 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr51Q8VGG9 307 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppa1Q9D819 289 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rp2Q9EPK2 347 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr948Q9EQ95 321 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr65A0A1B0GSF4 315 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3033M0QWI0 180 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3532M0QWL4 194 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MosP00536 390 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccl5P30882 91 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sult2a2P50236 285 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr9Q60885 312 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CslQ80X68 466 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Neil1Q8K4Q6 389 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cacul1Q8R0X2 377 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 C8gQ8VCG4 202 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prss42Q8VIF2 335 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CsprsQ99388 208 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tcf23Q9JLR5 209 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 LipgQ9WVG5 500 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Frem2Q6NVD0 3160 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnaset2aC0HKG5 259 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnaset2bC0HKG6 259 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 P06321 130 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myf5P24699 255 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r212Q8R268 357 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SvbpQ99LQ4 66 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Med29Q9DB91 199 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ca5bQ9QZA0 317 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm12117V9GXK0 151 aa20.17■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mfap2P55002 183 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ctf2P83714 204 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vezf1Q5SXC4 518 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nxph1Q61200 271 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1113Q7TR54 326 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam124bQ8BLQ0 456 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Asb13Q8VBX0 278 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dmbx1Q91ZK4 381 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Med28Q920D3 178 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Siglec5Q920G3 569 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc22a5Q9Z0E8 557 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dock7Q8R1A4 2130 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa20.16■□□□□ 0.82
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr239A0PK55 315 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.1 ms