RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619046.4

ATP6AP1-210, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP6AP1, Length 2,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-210ENST00000619046 PAPPAQ13219 1627 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 ARID5BQ14865 1188 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 STX1AQ16623 288 aa14.69□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 MYH7P12883 1935 aa14.69□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 CTAGE5O15320 804 aa14.69□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 CBX1P83916 185 aa14.69□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 DRC7Q8IY82 874 aa14.69□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 A0A087WZG4 1122 aa14.68□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.68□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 H7C1W4 665 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 CYP27B1O15528 508 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 TICAM2Q86XR7 235 aa14.68□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 E7EWF7 191 aa14.67□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 EVCP57679 992 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 CCZ1BP86790 482 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 FBXL16Q8N461 479 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 GPR108Q9NPR9 543 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.67□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 KCND1Q9NSA2 647 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 FOSBP53539 338 aa14.66□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 NBPF14Q5TI25 921 aa14.65□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 NBPF11Q86T75 865 aa14.65□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1-210ENST00000619046 DCAF5Q96JK2 942 aa14.65□□□□□ -0.06
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ATP6AP1-210ENST00000619046 NEMFO60524 1076 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 FSIP1Q8NA03 581 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 TIMM10P62072 90 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 ANO10Q9NW15 660 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 PPFIA3O75145 1194 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 GUCY1B3Q02153 619 aa14.63□□□□□ -0.07
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ATP6AP1-210ENST00000619046 CHST3Q7LGC8 479 aa14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 A0A1W2PQ27 194 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 A0A1W2PQ64 194 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 A0A1W2PQD8 194 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 CCDC69A6NI79 296 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 KINO60870 393 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 CEP135Q66GS9 1140 aa14.62□□□□□ -0.07
ATP6AP1-210ENST00000619046 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.62□□□□□ -0.07
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